当医学遇见AI:长海医院生物信息学培训第一期在兰卫医学圆满收官
10月25日至26日,由上海市生物信息学会教育与国际合作工作委员会主办、长海医院承办,兰卫医学协办的“第二届长海医院八年制科研能力提升培训暨生物信息学专项培训”第一阶段培训圆满收官。本次培训聚焦生物信息学前沿理论与实操技能,夯实科研基础,吸引了医院55名在培八年制学员的积极参与。
医学遇见AI

开班仪式上,蔡行健副院长以“三个桥梁”的战略定位为培训定调:生物信息学是连接基础研究与临床转化的桥梁,是贯通传统医学与精准医疗的桥梁,更是架设中国医学与国际前沿的桥梁。他特别提到,去年首届医院八年制科研能力提升培训班的学员中,已有12人在基因组学领域发表SCI论文,“这些数据印证了生物信息学赋能医学创新的巨大潜力”。

首日课程以“理论深度”为核心,系统构建生物信息学知识体系。在“大师讲堂”环节,赵兴明教授、张勇教授、刘琦教授等专家分别围绕“AI赋能的微生物组学”“转录调控与表观遗传组学”“组学人工智能与精准医学”展开精彩分享,激发学员对前沿技术的浓厚兴趣。吴丹、倪志伟、李刚、陈雨虹等青年讲师则从科研设计、基因组、表观组及TCGA数据库等角度,系统讲解生物信息学在医学研究中的应用逻辑。




次日,学员们转战兰卫医学总部,开启“实操落地”的深度训练。倪志伟博士带领的“Linux基础特训营”中,学员们从命令行操作起步,逐步掌握生物信息分析的“底层语言”;在李刚博士指导的R语言工作坊中,基因数据可视化图谱首次在学员手中生动呈现,有人激动地在朋友圈分享“人生第一张热图”。学员们还参观了兰卫医学科创中心,在真实科研场景中体验“从样本到论文”的全流程。


短短两天的培训,学员们实现了显著的知识跃迁:从对“单细胞分析”的模糊认知,到能独立操作Seurat包进行细胞聚类;从对“表观遗传调控”的理论理解,到能运用ChIP-seq数据解析基因表达机制。

本次培训最宝贵的成果,并非仅仅是软件操作的熟练,更是“生信思维”的建立。一位来自消化内科的八年制学员,在培训期间深受启发,将所学知识与自身的临床专业紧密结合,构思并提出了一个“基于肠道菌群特征的结直肠癌预警模型”。该模型旨在通过分析肠道微生物组的特征性变化,为结直肠癌的早期筛查和风险预警提供新的思路和方法,该课题目前已进入课题设计阶段。

本阶段培训内容扎实、节奏紧凑,理论与实操并重,获得学员一致好评。第二阶段课程将于12月20日至21日举行,进一步聚焦单细胞技术、AI应用与课题汇报,助力学员全面提升科研能力。