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整体概述

        兰卫医学专注于医学领域的创新型科学研究,旨在通过前沿的检测技术和生信分析手段为研究者提供一站式全流程的科研解决方案。通过开展科研合作,助力研究者深入挖掘生物学规律,探索生命现象的本质,为医学研究提供坚实的理论和实证基础。

        兰卫生信分析致力于运用前沿的生信分析手段,如人工智能(AI)、生物医学大模型、机器学习、深度学习等,结合多组学数据和临床大数据,为研究者从多维度、更深入的研究疾病的发生和发展规律提供新的视角和工具。同时,我们期望通过搭建的大数据存储和运算平台,与更多的医学科研工作者进行科研合作,深入挖掘科研数据价值,促进临床研究成果转化,推动疾病预防、诊断和治疗的发展。


兰卫优势

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    一站式生信分析
    一站式生信分析

            提供从数据处理到分析、解读的全流程服务,全方位满足多层次分析需求,打造一站式生信分析解决方案。助力研究者提升科研效率,加速科研进程,提高科研成果的产出质量。

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    个性化分析与数据挖掘
    个性化分析与数据挖掘

            根据科研需求和数据特点,量身定制个性化生信分析方案。运用多组学分析手段,以及机器学习、数据建模、深度学习等算法工具,充分挖掘数据价值,全方位提升科研质量。

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    生物学意义解读
    生物学意义解读

            依托医学和科研数据库,将临床数据进行功能性解读与变异解读。借助专业的图表绘制和美化将复杂分析结果以直观图形呈现,助力研究者理解数据背后的生物学意义和科研价值。

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    专业的生信分析团队
    专业的生信分析团队

            生信分析团队以上海市生物医药技术研究院谢鹭教授为科研带头人,汇聚了多名来自985、211高校和科研院所的硕士和博士研究生,具有扎实的专业功底和丰富的生信分析经验。

服务内容

  • 单细胞转录组学

  • 空间组学

  • 微生物组学

  • 基因组学

  • 转录组学

  • 代谢组学

  • 蛋白质组学

单细胞转录组学
单细胞转录组学测序

基因比对定量、细胞亚群注释鉴定、亚群基因表达差异、细胞轨迹分析、富集分析、拟时序分析、细胞通讯分析、拷贝数变异分析、转录因子调控分析

单细胞免疫组库测序

V(D)J基因使用频率分析、VJ分布、CDR3序列长度分析、克隆多样性分析、Motif分析

单细胞ATAC测序

参考基因组比对、peak分析、降维聚类分析、motif分析、功能分析、细胞通讯分析、拟时序分析

空间组学
10x Visium空间转录组测序

基因组比对和表达量统计、空间聚类分析、解卷积分析、空间差异基因分析、空间通讯分析、组间差异基因分析、空间细胞组成分析

10x Visium HD空间转录组测序

基因组比对和表达量统计、空间聚类分析、空间拟时序分析、空间通讯分析、功能富集、空间差异基因分析、组间差异基因分析、细胞分割

10x Xenium 原位分析

差异基因分析、功能注释、降维聚类分析、细胞类型鉴定、细胞分割

空间蛋白质组学

单细胞识别、空间定位、距离分析、特异性组织识别

微生物组学
微生物扩增子测序

物种注释与组成分析、菌群多样性分析、物种差异分析、临床因子关联分析、模型预测分析、相关性网络分析、功能预测分析、进化分析

微生物宏基因组测序

物种注释、功能注释、物种组成分析、比较分析、组间差异分析、临床因子关联分析、预测模型分析

微生物单菌分析

基因组拼接、基因组组分分析、功能数据库注释、分泌蛋白预测、蛋白跨膜结构预测

基因组学
基因组重测序

参考基因组比对、SNP/InDel/SV/CNV分析、基因组变异、突变位点筛选、显性/隐性遗传模式分析、易感基因筛选、高频突变基因、杂合性缺失、肿瘤异质性和克隆结构分析、纯合子区域(ROH)分析、蛋白功能互作网络(PPI 分析)、功能富集、HLA分析、线粒体基因组分析、生存分析

全外显子测序(WES)

参考基因组比对、SNP/InDel/SV/CNV分析、基因组变异、突变位点筛选、显性/隐性遗传模式分析、易感基因筛选、高频突变基因、杂合性缺失、肿瘤异质性和克隆结构分析、纯合子区域(ROH)分析、蛋白功能互作网络(PPI 分析)、功能富集、HLA分析、线粒体基因组分析、生存分析

转录组学
RNA-seq测序

参考基因组比对与基因定量、基因表达水平分析(相关性,差异表达分析)、功能富集分析、蛋白互作网络分析、WGCNA分析、融合基因分析、可变剪切分析、SNP/Indel分析、GSEA分析、肿瘤纯度与评分、免疫表型评分、肿瘤微环境-xcell

全转录组测序

参考基因组比对与基因定量、基因表达水平分析(相关性,差异表达分析)、功能富集分析、lincRNA/circRNA/miRNA/mRNA分析与关联互作、转录因子及其靶基因预测分析、蛋白互作网络分析、WGCNA分析、融合基因分析、可变剪切分析、SNP/Indel分析分析、ceRNA共表达分析

代谢组学
非靶向代谢组学

代谢物注释、样本比较分析、差异代谢物分析、功能分析、ROC分析、代谢关联分析

靶向代谢组学

差异代谢物筛选、统计分析、差异代谢物分析、功能富集、

蛋白质组学
DIA蛋白质检测

差异蛋白筛选、蛋白表达水平分析、蛋白功能互作网络(PPI 分析)、功能富集分析

Olink蛋白质组检测

数据预处理、统计分析、ROC分析、Logistic模型分析、Cox比例风险回归模型、机器学习模型

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服务案例

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    单细胞转录组 scRNA
    细胞亚群注释:根据临床样本的生物学意义,进行cluster细胞注释。

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    空间转录组-ST
    空间转录组聚类分析:t-SNE 分布图

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    联合分析- sc & olink
    通过对scRNA 的细胞亚群研究,发现 marker基因 在不同亚群的高表达特征。